1．最高決策機構(gòu)——部長會議。世界貿(mào)易組織所有成員的代表組成部長會議。部長會議是最高級會議。部長會議履行世界貿(mào)易組織的職能，并為此采取必需的措施。部長會議有權(quán)對所有多邊貿(mào)易協(xié)議中的任何事項作出決定。
2．常設(shè)權(quán)力機構(gòu)——總理事會。在部長會議休會期間，部長會議的職能由總理事會行使?？偫硎聲筛鞒蓡T代表組成，根據(jù)情形召開會議?？偫硎聲瑫r履行爭端解決機構(gòu)和貿(mào)易政策審議機構(gòu)的職責(zé)。但是，爭端解決機構(gòu)和貿(mào)易政策審議機構(gòu)有自己的主席，負責(zé)機構(gòu)的運作。
3．（部門貿(mào)易）理事會。根據(jù)世界貿(mào)易組織協(xié)定附件的不同調(diào)整范圍，設(shè)立了貨物貿(mào)易理事會、服務(wù)貿(mào)易理事會以及與貿(mào)易有關(guān)的知識產(chǎn)權(quán)理事會。理事會依總理事會的總體指導(dǎo)運作，分別履行貨物貿(mào)易多邊協(xié)議、服務(wù)貿(mào)易總協(xié)定和與貿(mào)易有關(guān)的知識產(chǎn)權(quán)協(xié)定以及總理事會指定的職能。各理事會的成員資格對全體成員開放，但并非所有成員代表都參加理事會。各理事會設(shè)有下屬機構(gòu)。
4．（綜合）委員會。環(huán)境與貿(mào)易委員會、收支平衡委員會、貿(mào)易與發(fā)展委員會、最不發(fā)達國家小組委員會、國際收支限制委員會、預(yù)算、財務(wù)和行政委員會，是在總理事會之下設(shè)的六個委員會，負責(zé)處理諸如貿(mào)易與發(fā)展、環(huán)境、區(qū)域貿(mào)易協(xié)定以及行政事務(wù)。各委員會行使有關(guān)協(xié)議賦予的職責(zé)及總理事會賦予的其他職責(zé)，并向總理事會報告工作。
5．下屬機構(gòu)。幾乎每一個理事會／委員會都有下屬機構(gòu)，例如，貨物貿(mào)易理事會有多個專門委員會處理各專門問題（如農(nóng)產(chǎn)品、市場準人、補貼、反傾銷措施）。
6．世界貿(mào)易組織秘書處和總干事。世界貿(mào)易組織的工作機構(gòu)，是總干事領(lǐng)導(dǎo)的秘書處。世界貿(mào)易組織秘書處設(shè)在日內(nèi)瓦?？偢墒掠刹块L級會議任命?？偢墒氯蚊貢幝殕T，并依照部長會議通過的條例，確定他們的職責(zé)和服務(wù)條件。秘書處的職責(zé)主要包括：為世界貿(mào)易組織的代表機構(gòu)（如理事會、委員會、工作組等）進行談判和執(zhí)行協(xié)議，提供行政和技術(shù)支持；為發(fā)展中國家，特別是最不發(fā)達國家，提供技術(shù)援助；在貿(mào)易爭端解決過程中，由法律雇員提供有關(guān)規(guī)則和先例解釋方面的法律幫助；處理新成員的加入談判，為準備加入的國家提供咨詢。總干事和秘書處的職員純屬國際性質(zhì)，在履行職責(zé)方面，不應(yīng)尋求和接受任何政府或當局的指示；各成員不應(yīng)對他們履行職責(zé)施加影響。
